鼻咽癌的病因不明，推测遗传因素和生活习惯等因素，在鼻咽癌发生上可能起着重要作用。遗传因素：根据细胞染色体及人类组织相容性抗原(HLA)等的研究，鼻咽癌有明显民族聚集现象。饮食因素：饮食过多的咸鱼、腊味和腌制含亚硝胺类化合物的食品，这些食物有诱发鼻咽癌的作用，水、大米中镍、铅等微量元素的改变也可能与鼻咽癌的发生有关。EB病毒：从鼻咽癌的组织中分离出带EB病毒的类淋巴母细胞株，找到了EB病毒颗粒。鼻咽癌体内存在EB病毒高滴度的抗体，病情严重者滴度高，说明EB病毒与鼻咽癌关系密切。