第一，目前临床使用的抗病毒药物，都不能直接进入到肝细胞核内，无法彻底清除发生在肝细胞核的病毒复制繁殖，由于无法完全清除导致肝病发生的病毒源，所以单靠抗病毒手段从理论上看，很难彻底治愈病毒性肝病。
         第二，由于抗病毒药物的抗病毒目的不能完全达到，病毒仍然或多或少的在繁殖、并在损伤肝脏，所以肝脏仍然处在或快或慢的进行性损伤进展状态。这种状态的日久持续和迁延，必然会导致肝脏功能和结构的日渐衰竭和损伤。
         第三，目前抗病毒药物的价格都比较昂贵，加之不能彻底清除病毒，疗程长，病情容易反复，所以患者的医疗费用非常巨大，这对患者个人，社会都是一个非常严峻的考验。